ll presbiterio si presenta come uno spazio quadrato, separato dalla navata centrale, dai transetti e dall’abside per mezzo di archi su due dei quali si trovano raffiguratel’Annunciazione e la Presentazione di Gesù al Tempio.
Al di sopra del presbiterio si innalza la cupola, sorretta da un tamburo decorato con le immagini di evangelisti e profeti.
Al centro della cupola si trova invece il Cristo Pantocratore circondato da angeli e arcangeli. Un altro Cristo Pantocratore è raffigurato nel catino absidale, al di sopra di un mosaico del XVII secolo con la Madonna tra la Maddalena e San Giovanni Battista.
